1.
Поверхность оболочки, что сформировалась вокруг тела D-4646 в результате употребления SCP-125-UA
Правильно: сформировавшаяся вокруг тела.
2.
в восточных областях
В оригинале: "у південних областях". Південь - юг,
3.
Работники Фонда в сотрудничестве с сотрудниками
Сотрудничество с сотрудниками — тавтология. Здесь или заменить на "в кооперации"/синонимы, или убрать "сотрудниками" и подвести окончания последующих слов.
4.
, что граничат с морями,
Буквализм, граничащими с морями.
5.
Как минимум один агент Фонда под прикрытием также должен работать
Слово "также" утяжеляет вступление предложения и излишне, его стоит убрать.
6.
фиксируется в восточных областях Украины, что граничат с морями.
Без буквализмов:
фиксируется в южных областях Украины, граничащих с морями.
7.
потому на данном этапе
Буквализм. В связи с чем.
8.
Приложение с экспериментов у вас оформлено неправильно, требуется добавить модуль ксс, идущий после него в оригинале.