SCP Foundation

Препарат должен храниться в общем хранилище медикаментов Участка 147 в ячейке хранения

Храниться в хранилище в ячейке хранения

можно было получить только, прочитав

Запятая стоит перед "только" (перемещение)

проговорили три часа, после чего договорились

Проговорили - договорились

Задача выглядела нетрудной.
Работа казалась несложной.

Через несколько абзацев попадаются предложения с практически идентичны смыслом, чего недостаточно, чтобы забыть упоминание первого

дал понять, что работает над какой-то секретной и очень важной программой и что когда-нибудь они смогут заняться ею вместе,

Запятая после "программой"

— Проверено, мемагент стёрт. Не переживайте. — Он толкнул дверь и вошёл внутрь. Юрий следовал за ним, ожидая увидеть такой же мрак, как и в остальных частях комплекса,

Дальше идёт средний абзац с несколькими предложениями, предлагаю отделить.

Девушке на вид было около сорока, но внутреннее чутьё подсказывало Юрию, что на самом деле она гораздо моложе.

Даже если это потому, что ему чутьё подсказывало, то слова "девушка" и "около сорока" появляются раньше, несостыковываясь.

данные, полученные из медицинских отчётов, отражающие стремительное поголовное заражение

По тексту довольно много причастий и деепричастий, написанных вместе, но этот пример слишком выделяется.

Один из последних не заражённых сотрудников

"Незаражённых" слитно

но всё никак не мог привыкнуть к постоянному чувству потери, и смерть этой пациентки не была исключением. Он всё не мог перестать

Всё - всё

одобренный Комитетом по этике для проведения

"этике" с заглавной, по всему тексту

но у них отсутствует функция принудительной репликации

Может сойти за придирку к видению меметики, но здесь противопоставление функции повторения, подразумевающее, что она присуща "классическим" мемам.

Юра собирался устроить подопытному контролируемую передозировку промазином, заранее подготовившись к реанимационным действиям, интубации, промыванию желудка и прочему. Затем подопытного планировалось заразить мемагентом и наблюдать за последствиями. Никто особо не верил, что подопытный доживёт хотя бы до момента, когда у него прояснится сознание, но после одной неудачной попытки эксперимент всё-таки увенчался успехом.

Подопытный - подопытный - подопытный

улучшений или ухудшений, — словом,

Лишняя запятая после "ухудшений"

однако сейчас, для вашей текущей задачи

Лишняя запятая

а так же рядом других соединений

Также

Побочными эффектами от единичного принятия OLS-34 могут быть спутанность, повышенное внутричерепное давление, бессонница, депрессия, и проявляются в 15-20% случаев.

"которые проявляются"?

прямо при въезде в участок 147

"Участок" с заглавной